Со времени приключений Наоты и Харухары Харуко прошло много лет. Война между сущностями, известными под именами МедМеханика и Братство поглотила галактику.
Хидоми - обычный подросток, она верит, что в ее скучной среднестатистической жизни не может произойти ничего увлекательного. Но вскоре после появления в ее школе нового учителя, Харуко, МедМеханика атакует город, где живет Хидоми, и девушка обнаруживает в себе нечто, что может спасти всех, нечто, что может освободить лишь Харуко.
Но почему Харуко вернулась на Землю?
Что случилось с ее рикенбекер 4001, оставленной Наоте?
Куда отправился человекоподобный робот Канти?
(с) для Find Anime
Второй сезон FLCL Progressive покажут в 6 эпизодах в США на канале Cartoon Network в рамках блока Adult Swim / Toonami.
В Японии же FLCL 2&3 выйдет в формате полнометражных фильмов. Причём выйдут они в обратном порядке: FLCL Alternative – 7 сентября, а FLCL Progressive – 28 сентября.