Война между человечеством и зентради закончилась, и объединенные народы отправляют совместную экспедицию в центр галактики. Флот колониальных кораблей называют "Макросс Фронтир". Межзвездные раздоры оставлены в прошлом, и жизнь в колонии идет своим чередом. В 2059 году известная певица Шерил Ноум организует на Макроссе Фронтир концерт. Начинающий пилот меха Саотомэ Альто и его товарищи эскортируют ее, но уже во время выступления начинается вторжение биомеханических инопланетян ваджра. Ваджра прорвались сквозь защитный периметр, окружавший корабль, и врезались неподалеку от концертного зала, повергнув город в хаос. Слушателей эвакуируют, но девушка по имени Ранка Ли отстает. Ваджра ловят ее в…

Уже полтора столетия два межзвездных государства борются за власть над Млечным Путем. Галактический Рейх, абсолютистская монархия под началом Кайзера Фридриха IV и косной аристократии, стремится подавить мятежников, посмевших восстать против неприкосновенной короны. Союз Свободных Планет, представительная демократия, возглавляемая коррумпированным Высшим Советом, разрушается изнутри избранными правителями, пытающимися использовать войну и конфликты как средство, чтобы заработать поддержку населения. Но затянувшееся противостояние вот-вот закончится, ведь по обе стороны взошли звезды двух военных гениев. Райнхард фон Лоэнграмм, мелкий дворянин и генерал-адмирал Рейха, поднявшийся благодаря своим…

В Токио будущего секретная организация "Кестос" охотится на людей с пробудившимися уникальными способностями. Называемые Аттракторами, эти люди объединяются, чтобы защититься. Возглавляет их юный Квон, желающий спасти стольких Аттракторов, скольких сможет.