Надо же. Вся моя стройная теория о том, что истинный злодей - это Шака, рассыпалась в прах. А всё так хорошо сходилось. У него был доступ к пограничному куполу, чтобы заманить CP-0. У него достаточно полномочий, чтобы приказывать Серафимам. И у него достаточно ума и амбиций, чтобы попытаться свергнуть Вегапанка. Прибавьте сюда еще обостренное чувство справедливости - он видит, что гениальный ученый прислуживает МП, а агенты шастают, как у себя дома.
Жаль, что я ошибся.