Война между человечеством и зентради закончилась, и объединенные народы отправляют совместную экспедицию в центр галактики. Флот колониальных кораблей называют "Макросс Фронтир". Межзвездные раздоры оставлены в прошлом, и жизнь в колонии идет своим чередом. В 2059 году известная певица Шерил Ноум организует на Макроссе Фронтир концерт. Начинающий пилот меха Саотомэ Альто и его товарищи эскортируют ее, но уже во время выступления начинается вторжение биомеханических инопланетян ваджра. Ваджра прорвались сквозь защитный периметр, окружавший корабль, и врезались неподалеку от концертного зала, повергнув город в хаос. Слушателей эвакуируют, но девушка по имени Ранка Ли отстает. Ваджра ловят ее в…