Прошло полгода после событий первого фильма. Фейт вернулась в Уминари, а Линди стала ее опекуншей. Они живут обычной жизнью, и Фейт ходит в начальную школу вместе с Нанохой и ее друзьями. Воссоединение, увы, было недолгим - на них нападают четыре древних мага, называющих себя Волкенриттерами. Понявшим их мотивы Нанохе и Фейт придется поторопиться, чтобы предотвратить активацию особо опасного артефакта под названием Книга Тьмы. (c) FindAnime

Молодой звездный археолог Юно Скрайя прилетел на нецивилизованную планету №97 (она же Земля), чтобы собрать утерянные артефакты. Увы, Драгоценные Семена, хранилища магической энергии, уже включили защитную программу, и Юно, получив по первое число, быстро понял, что сам много не навоюет. Не беда – на то есть местные жители. 9-летняя Наноха Такамати, получив мысленный призыв о помощи, спасла раненого Юно, и, обсудив с ним ситуацию, согласилась помочь. Но недолго Наноха вместе с Юно (для конспирации принявшим облик горностая) вели жизнь махо-сёдзё и ее спутника-добуцу. Только-только японская школьница вошла во вкус и развила магические способности, как пришлось столкнуться с такой же девочкой по…