Сюжет рассказывает о частной академии, которая стала известна благодаря частым посещениям духов, в особенности девочки-призрака по имени Юко. По необъяснимой причине первогодка Тэйити Ниия единственный, кто может ее видеть. Юко абсолютно ничего не помнит о своей смерти, и даже не имеет представления кто или что могли к ней привести. Юко и Тэйити создают клуб для расследования обстоятельств смерти девочки и других мистических вещей связанных с академией.

Призраки, странные происшествия и даже боги продолжают возникать возле Арараги Коёми и его подруг - скромного гения Ханэкавы Цубасы, вампирши и любительницы пончиков Осино Синобу, радостной кусаки Хатикудзи Маёи, очаровательной преследовательницы Сэнгоку Надэко и резкой цундэрэ Сэндзёгахары Хитаги. Вместе они борятся против надвигающейся тьмы. Над Арараги нависает выпускной, и ему нужно поскорее задуматься о дорогах, которые он выберет, и о друзьях, с которыми продолжит общаться. Но Арараги исчез, а странные события его ждать не собираются - в его отсутствие возник жестокий дух тигра. Его жертва - Ханэкава, и ей нужно постоять за себя или принять убежденность призрака в человеческой слабости.…